Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms