Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux2P70298 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms