Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms