Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf6P70279 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms