Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms