Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps3P62908 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps3P62908 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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