Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp46P62069 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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