Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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