Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms