Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CckbrP56481 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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