Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms