Protein–RNA interactions for Protein: P54103

Dnajc2, DnaJ homolog subfamily C member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc2P54103 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc2P54103 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms