Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41l4aP52963 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms