Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TspoP50637 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TspoP50637 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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