Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms