Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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