Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cxcr2P35343 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cxcr2P35343 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcr2P35343 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcr2P35343 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcr2P35343 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr2P35343 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms