Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd22P35329 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms