Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp4P35123 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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