Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Saa4P31532 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Saa4P31532 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Saa4P31532 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Saa4P31532 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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