Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp3P28862 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms