Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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