Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nckap1P28660 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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