Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BgnP28653 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BgnP28653 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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