Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms