Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LoxP28301 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LoxP28301 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LoxP28301 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LoxP28301 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LoxP28301 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LoxP28301 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms