Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb1P28230 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms