Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax3P24610 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms