Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms