Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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H2-D1P14427 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-D1P14427 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-D1P14427 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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H2-D1P14427 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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