Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms