Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcp1P11983 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms