Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PolP10400 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PolP10400 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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