Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms