Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms