Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms