Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrlP06879 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrlP06879 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrlP06879 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrlP06879 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms