Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MybP06876 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MybP06876 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MybP06876 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MybP06876 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms