Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06336 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06336 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06336 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06336 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06336 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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