Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms