Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01789 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01789 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P01789 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P01789 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P01789 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P01789 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01789 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms