Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dync1i1O88485 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dync1i1O88485 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dync1i1O88485 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms