Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms