Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm10509O88255 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms