Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SfnO70456 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SfnO70456 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SfnO70456 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SfnO70456 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms