Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn20O55082 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms