Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnk2O54967 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms