Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole2O54956 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms