Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6bO54951 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms