Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms